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设置拦截短信后仍然能够收到短信的原因可能有以下几点。
1、手机安全软件可能不够智能或有缺陷，无法准确识别并拦截所有垃圾短信，一些垃圾短信可能会不断更换号码或伪装成其他信息，导致拦截软件无法准确识别并拦截。
2、手机号码可能被恶意软件或其他手段泄露，被恶意发送短信攻击，这种情况下，即使设置了拦截，仍然会收到这些攻击短信。
3、部分短信服务可能并不受拦截软件的限制，例如来自运营商的短信通知等系统短信，以及一些特定的应用程序短信等，这些短信通常会绕过拦截软件直接到达手机，还有一些特殊情况或紧急情况下发送的短信，可能也会不受拦截软件的限制，因此即使设置了拦截，也会收到这些短信。
针对以上原因，可以采取以下措施来减少收到垃圾短信的数量：
1、尝试使用更为智能或功能更全面的安全软件来进行拦截。
2、保护个人信息和手机号码，避免泄露。
3、对于一些不受拦截限制的短信，可以在手机设置中将其屏蔽或加入黑名单，也可以向相关机构或运营商投诉举报垃圾短信，以促进相关部门加强监管和打击垃圾短信行为。
尽管设置了拦截短信，但由于各种原因仍有可能收到垃圾短信，为了保护自己的手机安全和隐私，建议采取多种措施来减少收到垃圾短信的数量。